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手把手教学|如何利用DAVID数据库进行GO、KEGG富集分析

实验老司机  · 公众号  ·  · 2024-10-09 07:00
    

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一、 简介 DAVID数据库(https://david.ncifcrf.gov/home.jsp),是一个比较全面的功能注释工具。其全称为The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery,即注释、可视化、综合发现数据库。对于任何给定的基因列表,DAVID数据库可以轻松实现诸如功能注释、功能富集分析、功能聚类、基因名称转换等相关操作,这为了解大量基因背后的生物学意义提供了便利。 GO富集分析主要从生物学过程(Biological Process,BP)、细胞组分(Cellular Component,CC)、分子功能(Molecular Function,MF)三个维度揭示各基因集中基因在基因本体(Gene Ontology,GO)上的富集情况。 KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析则是用于分析基因或蛋白在KEGG通路中的富集情况的一种常见的生物信息学分析方法。其中,KEGG Pathway是用于反映分子相互作用、反应及关系网络的路径图,主 ………………………………

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