准确、高效、物理有效，中科大、北大提出「两段式」分子对接统一框架DeltaDock

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将 ScienceAI   设为 星标 第一时间掌握 新鲜的 AI for Science 资讯 编辑 | KX 分子对接是一种预测配体结合姿势的技术，在基于结构的药物设计中对于理解蛋白质-配体相互作用至关重要。最近，几何深度学习 (GDL) 对接方法，比传统采样方法具有更高的效率和准确性。 然而，当前的方法通常是针对特定的对接设置量身定制的，并且会忽略蛋白质侧链结构，难以处理大型结合口袋，难以预测物理有效结构。 为此，中国科学技术大学和北京大学的研究团队，提出了 一种新颖的两阶段对接框架 DeltaDock，包括口袋预测和位点特异性对接。 研究人员创新地将口袋预测任务重新定义为口袋-配体对齐问题，而不是在第一阶段直接预测。然 后， 遵循了两级从粗到细的迭代细化过程来执行位点特异性 （ site-specific） 对接。实验证明了 DeltaDock 的卓越性能。 值得注意的 ………………………………