课题组工作 ｜ Nat. Commun.｜ 基于体内代谢标记的时间转录组测序揭示急性肾损伤期间细胞RNA动态变化

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大家好！为大家分享一篇我们课题组近期发表在 Nature Communications 的文章，题目为 “ Dyna-vivo-seq unveils cellular RNA dynamics during acute kidney injury via in vivo metabolic RNA labeling-based scRNA-seq ” 。本工作发展了一种基于体内代谢标记的单细胞时间转录组测序方法（ Dyna-vivo-seq ）。该方法通过在单细胞水平同时分析新、旧 RNA ，解析了活体内转录组的动态变化。通过 Dyna-vivo-seq ，作者表征了小鼠急性肾损伤（ AKI ）早期阶段基因表达模式并证明了基于新生 RN A 的分析能够更灵敏的表征 AKI 过程中的基因响应。 Dyna-vivo-seq 方法为精确表征活体内转录组动态变化提供了强大的工具，为了解细胞对各种刺激的反应以及基因表达程序的变化提供了重要的手段。 01 背景介绍 生物体内的分子成分和相互作用网络动态变化对于理解生物过程至关重要。单细胞 RNA 测序（ scRNA-seq ………………………………