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单细胞细节笔记汇总

生信漫漫学  · 公众号  ·  · 2024-10-19 09:30

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写在开头 咱就是说,这个笔记可不得了,汇总了 #单细胞细节 十六篇文章的内容 所以呢, 这个字数呀是比较多的。但是正因为字数多,所以这个笔记非常之详细! 也是从系列推文内容的学习中,明白了如果详细解析一篇文章,可以得到这么多的知识点! 果然是单细胞的细节!每一个细节都值得学习和思考! 单细胞转录组降维聚类分群过滤基因和过滤细胞的区别 过滤细胞 首先是创建seurat对象时候的两个参数: min.cells : 指定了一个基因需要在至少多少个细胞中表达(即检测到的表达量大于0)的最小细胞数。例如,如果设置 min.cells = 5 ,那么只有那些在至少5个细胞中表达的基因才会被保留在最终的表达矩阵中。这个过滤步骤有助于去除那些可能由于随机噪声或测序误差而在极少数细胞中被检测到的基因,这些基因不太可能对生物学解释有贡献 m ………………………………

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