单细胞免疫组库VDJ| 从零开始scRepertoire分析，解决真实场景中可能的问题

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经过前面 单细胞免疫组库VDJ|从数据下载开始完成cellranger vdj分析（1） 中的cellranger count 和 cellranger vdj的分析后，得到了单细胞转录组 和 单细胞TCR的结果数据 。考虑到样本数太多， 选择既有RNA又有TCR样本的数据进行后续分析。重点解决以下三个小问题 1，只看TCR时（二），不同样本，不同分组情况下的clone差异以及变化； 2，TCR结合转录组数据（三+四），展示clone的分布可视化 以及 不同celltype中clone的差异以及变化； 3，一些可能的报错：（1）结合单细胞数据时；（2）官网链接中一些group相关的函数，按照推文或者使用??查看报错函数的具体说明 一 准备R包，数据集   安装 scRepertoire包，如果出现如下的Error，按照提示安装gsl后再安装 scRepertoire 。 BiocManager:: install ( "scRepertoire" ) suppressMessages( library (scRepertoire)) #Error: package or namespace load failed for ‘scRe ………………………………