专栏名称: 单细胞天地
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单细胞视角|基因调控研究、单细胞深度学习分析新工具;单细胞翻译测序、肿瘤异质性研究、跨物种数据整合、UDA-seq技术新突破等

单细胞天地  · 公众号  ·  · 2025-01-21 13:59
    

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分享是一种态度 1 TRIAGE R包助力基因调控研究,揭示细胞行为的奥秘 ❝ 文章:TRIAGE: an R package for regulatory gene analysis 链接:https://academic.oup.com/bib/article/26/1/bbaf004/7952010 代码:https://github.com/palpant-comp/TRIAGE_R_Package 基因调控是理解细胞发育、功能以及应对疾病的核心,但传统的RNA测序(RNA-seq)方法在揭示调控网络时存在局限。为此,昆士兰大学的研究团队开发了 TRIAGE R包 ,为基因调控研究提供了全新解决方案。 TRIAGE全称为“基于表观遗传学的转录调控推断分析”(Transcriptional Regulatory Inference Analysis Guided by Epigenetics)。它通过利用H3K27me3数据(与特定DNA调控区域相关的表观遗传标记),从RNA-seq数据中挖掘调控元件,揭示基因调控网络和细胞行为的奥秘。TRIAGE适用于批量和单细胞RNA-seq数据,能够无缝集成到现有分析流程中。 TRIAGE的设计初衷是与现有 ………………………………

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