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如何查找互作蛋白?

SCIPainter  · 公众号  ·  · 2024-10-10 11:00
    

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PPI分析也是各大组学研究的必备重点内容,那么如何查找互作蛋白呢?今天为大家分享5个好用的互作蛋白查询和预测数据库,可按需使用! 1.STRING 经典蛋白互作网络构建综合数据库,科研必备,当前版本12.0(持续更新),收录了来自 12535 个生物体的59309604个蛋白信息,点击SEARCH即可开始检索。 数据库链接: https://cn.string-db.org/ STRING支持8大检索方式: 1) Protein by name: 通过名称检索单一蛋白,查找与之互作的蛋白,绘制预测网络图。 2) Multiple proteins: 通过名称或上传文件来检索多个蛋白,查找他们之间的互作关系。 3) Proteins by sequences: 通过序列查找单一/多种蛋白。 4) Proteins with Values/Ranks: 以带有附加值(如Fold change、p value以及丰度等)的蛋白质列表的形式或直接上传文件进行富集分析及网络图绘制。 5) Protein families(“COGs”): 以COG蛋白质家族 ………………………………

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