Genome Biol | 李虹团队开发全新工具，助力探寻空间组学中的微环境异质性

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组织结构与微环境对于维持器官正常生理功能和疾病发生发展都起着极为关键的作用，如何观测和定量微环境一直是科学家们亟待解决的问题。近年来，空间组学实验技术的迅猛发展使在组织原位上高通量捕获单细胞层面的分子特征成为可能。空间组学技术正在重塑生命科学研究范式，但海量数据的解析却成为制约科学家成果产出的新瓶颈，现有的分析方法较为零散，迫切需要一个对微环境空间结构进行综合分析的工具包。 2025年3月，中国科学院上海营养与健康研究所 李虹 研究组在 Genome Biology 在线发表了题为 SOAPy: a Python Package to Dissect Spatial Architecture, Dynamics and Communication  的研究论文。该研究推出了 一款基于Python的分析工具SOAPy，针对空间组学微环境的异质性问题，提供了多样化的分析策略。通过四种模块——数据预处理、分子空间动态、空间 ………………………………