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插件 | 应用 GPT 开发「计算蛋白质理化性质参数」工具

生信石头  · 公众号  ·  · 2024-09-21 09:12

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写在前面 早前,我在 TBtools 中实现了一个基于网页爬虫的功能,通过逐个序列提交到 「Expasy ProtParam」来实现批量蛋白质序列参数,如分子量,等电点,芳香系数,不稳定系数,等等。 但是这个功能存在明显问题,也就是基于网络。网络可能不稳定,尤其是一些地域直接无法访问该服务网站。 为此,我后续有应用 GPT 开发了一个 Python 插件,这个插件基于 BioPython,所以出来体积比较大,大概 132 Mb。今天,我突发奇想,现在 o1-previw 推理能力不错,应该能够更好的实现的计算方法。不如让他从零用 Java 写一个,这样插件大小就超级mini。 开发过程 大体我用了半个小时,一边和朋友聊天,一边和GPT聊天最终解决问题。主要开发过程简述如下: 先用 o1-preview 模型直接写出 java 的分析脚本,对照正确结果,发现不对就让他优化,o1-preview 基本都能优化,不 ………………………………

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