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Nat. Mach. Intell. 前沿:深度学习从单细胞转录组数据重建细胞生长和动态轨迹

集智俱乐部  · 公众号  ·  · 2024-10-06 19:29

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关键词: 单细胞RNA测序,最优输运理论,神经微分方程,基因调控网络,细胞命运决定,复杂系统动力学建模 论文题目:Reconstructing growth and dynamic trajectories from single-cell transcriptomics data 论文来源: Nature Machine Intelligence 论文链接:https://www.nature.com/articles/s42256-023-00763-w 在细胞科学探究中,了解单个细胞随着时间推移如何生长、分化和变化,是揭示生命奥秘的关键。单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 技术使科学家能够详细分析单个细胞的基因表达情况,从而揭示细胞在不同状态下的动态变化。然而,由于测序过程会破坏细胞,导致无法追踪同一细胞在不同时间点的变化,这给研究细胞的成长轨迹和动态过程带来了挑战。 为了解决这一难题, Nature Machine Intelligence 近期发表的一项研究介绍了一种名为TIGON (Trajectory Inference with Growth via Optimal transport and Neural ne ………………………………

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