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前面我们分享了： 不要轻易尝试单细胞核转录组测序 ，因为如果大家的snRNA-seq的操作不够好，很容易导致很惨的数据质量。 哪怕是大家拿到了惨不忍睹的单细胞转录组数据集，也不是完全不可以发表，比如 2022的NG的文章：《Single-cell analyses define a continuum of cell state and composition changes in the malignant transformation of polyps to colorectal cancer》，就是 1,000 to 10,000 cells per sample for 48 polyps, 27 normal tissues and 6 CRCs 文献里面其实是有两个单细胞技术： single-nuclei transcriptomes (single-nucleus RNA sequencing (RNA-seq) (snRNA-seq)) epigenomes (single-cell assay for transposase-accessible chromatin using sequencing (ATAC-seq) (scATAC-seq)) 其中单细胞核转录组数据的第一层次降维聚类分群以及里面的少量的间质细胞和免疫细胞的细分如下所示 ： 第一层次降维聚类分群 是符合我们的认知的，通常我们拿到了肿
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