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ESICCC:作为评估、选择和整合细胞间通讯方法的系统计算框架

生信人  · 公众号  · 生物  · 2024-08-23 07:10

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细胞间通讯(CCC)是决定细胞功能和命运的关键,随着单细胞和空间转录组学的出现,很多CCC算法被开发出来,今天小编就给大家推荐一篇刚刚发表在Genome Research上的文章“ESICCC as a systematic computational framework for evaluation, selection and integration of cell-cell communication inference methods”文章评估了18种配受体推断方法包括5种配受体靶点推断算法,比较了这些方法的一致性、准确性、稳健性和可用性。并开发了一个pipeline- CCCbank,可以实现算法和数据库的多种组合。 背景: 细胞间互作在许多生理和病理过程中起着重要作用,如细胞分化、组织发育、免疫和疾病。因此阐明细胞间相互作用机制对于了解疾病的机制和治疗至关重要。 细胞相互作用以多种形式发生:物理接触(细胞黏附)和胞间通讯CCC(自分泌、旁分泌或内分泌)。CCC主要由胞间配体-受体(L/R)相 ………………………………

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