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百万次使用的高颜值在线绘图平台ImageGP系列教程

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2024-09-22 21:00

主要观点总结

在线平台BIC是ImageGP的重构升级版,提供多种绘图和分析功能。

关键观点总结

关键观点1: 平台功能与特点

BIC是一个在线绘图和分析平台,支持多种语言的绘图和分析,包括R语言和Python。平台提供快速部署工具,并生成结果或结果报告。累积使用70万余次,引用千次。

关键观点2: 左侧导航功能

BIC的左侧导航包括专业绘图、数据转换与提取、生物信息分析、交互可视化、资源等模块。其中专业绘图支持多种图形,如热图、箱线图、富集分析泡泡图等;数据转换和提取提供常见数据格式转换功能;生物信息分析包括WGCNA共表达网络分析、LEfSe特征物种鉴定等。

关键观点3: 交互式图和教程

BIC提供基于D3.js的交互式图系列,目前包括进化树展示和多序列比对展示。此外,还有视频演示教程,介绍如何使用该平台的各种功能。

关键观点4: 工具升级与错误处理

BIC平台不断升级和完善,提供Send error logs功能,用户遇到报错时可以直接发送错误信息,平台会处理。同时,平台还增加了工具使用记录和重分析功能。


文章预览

在线平台BIC (https://www.bic.ac.cn/BIC/#/, 点击 阅读原文 或 百度搜索 皆可访问到)是 ImageGP的重构升级版,重构于2020年初。 该平台采用配置文件快速部署工具、生成结果或结果报告。其绘图和分析基于 R 语言(ImageGP 包, 在早期ImageGP脚本的基础上重新进行了封装, GitHub, Gitee)、Python 语言。 累积使用 70 万余次(15 分钟内的多次使用只算作 1 次计数 ),引用千次! 左侧导航目前包括:1. Professional plots in seconds; 2. Data transform and extraction; 3. Bioinformatics analysis; 4. Interactive visualization; 5. Resource. 1.1  功能部分 1.1.1  Professional plots in seconds 目前支持 16 种基本图形,包括热图、箱线图、富集分析泡泡图、柱状图、火山图、PcOA 分析、Venn 图、直方图、线图等。每种图根据复杂度不同,有数目不一的可调节参数,可组合出很多复合图形。 1.1.2  Data transform and extraction 常见 ………………………………

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