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(三)当导师只给我一个RNA-Seq数据,我是怎么设计出5个课题的:高尔基体-胞外囊泡篇

猫头鹰教室  · 公众号  ·  · 2024-07-01 12:30
    

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这是这个主题的第三期,前面两期分别见链接: 当导师只给我一个RNA-Seq数据,我是怎么设计出5个课题的? (二)当导师只给我一个RNA-Seq数据,我是怎么设计出5个课题的? 前面2期中已经说的课题包括了: 炎症和抗炎策略; 细胞间通讯和神经元细胞焦亡; 从吞噬体到吞噬作用的靶向性。 本期我们说另外一个课题思路, 从GO条目中筛选出研究课题 。 4. 从GO条目中筛选出“高尔基体——胞外囊泡”主题。 前面的课题是从KEGG的条目中筛选的研究主题,当然还可以继续研究其它主题。 这次我从GO条目中筛选,并且重点从GO中的细胞元件(Cellular Component)分析。首先是显著富集的GO中的细胞元件(Cellular Component) (图1) : 图1 在这个结果中,我发现细胞外区域,特别是细胞膜和囊泡(vesicle)被富集的很多。在胞外囊泡中,我最熟悉的就是外泌体(Exoso ………………………………

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