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有了这12个时序共表达网络算法,WGCNA也不香了~

生信益站  · 公众号  ·  · 2025-01-08 08:00
    

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生信益站,一点就有益 ! 祝友友们天天开心,月月发 CNS~ 设我为🌟星标,每天就能第一时间看到推送啦~ 学会这些招儿 可能就毕不了业了(老板喜欢的不让走🤣) 比如基于 时序+网络模块 的 共表达调控网络 分析。 下面给大家介绍 12种 【 基因模块 】或者【 共表达网络 】分析方法。 1、常规相关性 比如皮尔森相关性。 参考教程: 如何绘制这般小清新的共表达网络图? 2、基于聚类(hclust/Mfuzz) 参考教程: (完整版) Mfuzz 这样画,秒变别人用不起的样子 3、WGCNA 优势:无尺度网络,功能强大。 参考教程: 做 WGCNA 网络分析你需要绘制哪些图? 4、TO-GCN 优势:适合2个条件的比较转录组分析。 参考教程: TO-GCN时序基因共表达网络原理、实战与可视化 5、Simple Tidy GeneCoEx 优势:引入了诱饵基因,解释性更强。 参考教程: WGCNA平替 ——Simple Tidy GeneCoEx 6、 ………………………………

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