代谢组学的整洁分析流程-tidymass-4-数据格式转换

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介绍 教程首页 教程地址：https://www.tidymass.org/docs/chapter3/ massconverter 可以用于基于 msconvert Docker 镜像将质谱数据转换为其他格式的数据。 “ 目前仅支持 macOS 或 Linux 操作系统。 安装 你可以从 GitLab 安装 massconverter ： if (! require (remotes)){ install.packages( "remotes" ) } remotes::install_gitlab( "jaspershen/massconverter" ) 或者 GitHub： remotes::install_github( "tidymass/massconverter" ) 或者 tidymass.org： source ( "https://www.tidymass.org/tidymass-packages/install_tidymass.txt" ) install_tidymass(from =  "tidymass.org" , which_package =  "massconverter" ) 引用 如果你在出版物中使用了 massconverter ，请引用以下内容： “ Shen, X., Yan, H., Wang, C. et al. TidyMass an object-oriented reproducible analysis framework for LC–MS data. Nat Commun 13, 4365 (2022). 非常感谢！ 第一部分  使用 Proteowizard 转换数据 getwd() #> [1] "/Users/xiaotaoshen/tidymass/tidymass-web ………………………………