东京大学Ikuro Abe组Nat Chem｜PLP依赖型酶多样性催化的林可酰胺类化合物生物合成的分子机制

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01 遇见/摘要 在林可霉素 A （ Lincomycin A ）和天青菌素（ celesticetin ）的生物合成途径中，有一对同源 PLP 依赖型酶 LmbF/CcbF ，即使它们能够识别相同的 S- 糖基 - 半胱氨酸底物，但 LmbF 催化 β- 消除反应生成硫醇，而 CcbF 催化脱羧偶联氧化脱氨反应生成 S- 乙醛，表现出了不同的反应机理和生物合成途径。本文作者通过 X-ray 晶体衍射、分子对接及分子动力学模拟等方法，揭示了 LmbF 与 CcbF 的结构 - 功能关系。其中，催化中心的芳香性残基对于底物的结合模式起到了至关重要的作用。此外，通过基于结构与计算的蛋白理性设计，将 CcbF 的催化功能转换为 LmbF 的催化功能，同时， LmbF 与 CcbF 的其余突变株也生成了新颖的非天然林可酰胺 S- 乙酰胺衍生物。   02 遇见/内容 林可酰胺类化合物，包括 lincomycin A( 1 ) ， celesticetin( 2 ) 和 Bu-2545( 3 ) ，是一类已经被广 ………………………………