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不要轻易尝试单细胞核转录组测序

单细胞天地  · 公众号  ·  · 2025-01-04 08:51
    

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单细胞核转录组测序(snRNA-seq)和单细胞转录组测序(scRNA-seq)是两种不同的单细胞分析技术,它们各自有优缺点 : 单细胞转录组测序(scRNA-seq)的优缺点 优点 :适用于新鲜组织样本。能够捕捉细胞质中的转录信息。适用于研究细胞异质性。 缺点 :对细胞活性和数量有较高要求,不适用于冷冻样本。某些细胞类型可能在解离过程中丢失,导致细胞类型的偏好。悬液消化过程可能引入应激基因表达,影响结果真实性。对于大细胞、形状不规则或细胞团块,可能无法有效捕获。 单细胞核转录组测序(snRNA-seq)的优缺点 优点 :细胞核的获取比细胞悬液简单,适用于冷冻样本。扩大了样本类型,包括复杂组织或珍稀样本。减少了人为引入的转录偏差,提高了结果的真实性。能够鉴定到的细胞类型更为全面和完整。 缺点 :可能检测到的基因数量较少 ………………………………

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