Nature Plants：翟继先/邓娴合作解析拟南芥着丝粒、端粒和rDNA簇的表观遗传特征

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2023年8月20日，南方科技大学生命科学学院生物系翟继先团队与中科院遗传发育所曹晓风课题组青年研究员邓娴合作在 Nature Plants 上发表了题为 Single-molecule Targeted Accessibility and Methylation Sequencing of Centromeres, Telomeres, and rDNAs in Arabidopsis 的研究论文。 研究团队开发了能够检测植物中异染色质区域的染色质可及性（chromatin accessibility）和DNA甲基化（DNA methylation）的STAM-seq (Single-molecule Targeted Accessibility and Methylation Sequencing)技术，并利用该方法对拟南芥野生型和DNA甲基化突变体中高度重复的着丝粒、端粒和45s rDNA区域的染色质可及性和DNA甲基化进行了系统研究。 作者通过使用外源的甲基转移酶EcoGII处理细胞核，将染色质开放区域的A标记为6mA。结合ONT（Oxford Nanopore Technologies）平台的选择性测序（Adaptive sampling）功能，能够在测序过程中实时对基因组目标区域 ………………………………