中科院生物物理所王殿冰团队Adv. Sci.：ProT-Diff：通过整合蛋白质语言和扩散模型从头生成抗菌肽序列的模块化高效策略

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第一作者： Xue-Fei Wang 通讯作者：张先恩，王殿冰，李哲 通讯单位：深圳理工大学 中科院生物物理所，中科院生物物理所，普瑞基准（北京）科技有限公司        研究速览 近期，中科院生物物理研究所王殿冰 等人 在Advanced Science发表了ProT-Diff：通过整合蛋白质语言和扩散模型从头生成抗菌肽序列的模块化高效策略的文章。 抗菌肽（AMPs）是治疗抗生素耐药病原体的一种有前途的解决方案。然而，在不事先了解肽结构或序列比对的情况下有效生成不同的AMPs仍然是一个挑战。这里引入了ProT-Diff，这是一种模块化的深度生成方法，它将预训练的蛋白质语言模型与扩散模型相结合，用于从头生成AMPs序列。ProT-Diff在几个小时内生成数千个具有不同长度和结构的AMPs。经过计算机理化筛选后，选择了45种肽进行实验验证。四十四种肽对革兰氏阳性菌或革兰氏 ………………………………