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我们经常看到 很多单细胞高分文章中都给它的umap注释结果加了一个圈圈,让读者的视角更集中在一个无形的圈圈上面 ,今天来学习一下怎么操作吧。这个加了圈的高颜值UMAP散点图来自文献:《 Molecular Pathways of Colon Inflammation Induced by Cancer Immunotherapy 》, 于 2020年8月份发表在顶刊Cell上 。 图注:图中为所有的CD45+ 免疫细胞 Figure 1 Global Analysis of Immune Cell Populations in CPI Colitis (C) Identification of colon CD45+ immune cell clusters across all samples (n = 5–6 subjects per cohort). 数据背景:三个分组 +CPI colitis全称:Check point inhibitor-induced colitis (1) +CPI colitis :经免疫检查点抑制剂(CPI)治疗且经组织学确诊为结肠炎的黑色素瘤患者(n = 8,+CPI结肠炎); (2) Normal control :接受筛查性肠镜检查的健康成年人,其年龄与上述患者相近(n = 8,对照组); (3) +CPI no colitis :经免疫
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