经验总结｜ACT数据库的使用教学：单细胞转录组自动注释、细胞marker查询

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大家好呀！今天来跟大家分享一个我在分析自己的单细胞转录组数据的时候经常用到的一个数据库，那就是 Annotation of cell types (ACT) 。 数据库链接： http://xteam.xbio.top/ACT/ 在我们分析单细胞数据的时候，常规流程当中最让人纠结的一个步骤就是细胞类型的注释。毕竟细胞注释的结果是我们后续进行任何分析的基础。 手动注释毫无疑问是当前最主要的细胞类型注释方法，被视为绝对的金标准，但尝尝会受到专业知识和速度的限制。我自己在进行细胞类型注释时，经常会使用多种方法，耗费两三天的时间反复斟酌。因此，研究人员需要一款基于细胞标记物（cell marker），能够准确、快速、便捷地自动完成细胞类型注释的工具。 ACT是哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院肖云课题组于2023年11月在Genome Medicine杂志发表的题为Annotation of cell types (ACT): a conveni ………………………………