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Scupa:首个全面评估免疫细胞极化的算法~

生信益站  · 公众号  ·  · 2025-02-28 10:59
    

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生信益站,一点就有益 ! 祝友友们天天开心,月月发 CNS~ 设我为🌟星标,每天就能第一时间看到推送啦~ Scupa 是一个 R 包 用于 scRNA-seq 数据的免疫细胞极化评估 细胞极化 指的是细胞在某种功能或形态上表现出明显的极性差异。这种现象在很多细胞类型中都可以观察到,包括神经元、上皮细胞和某些免疫细胞。细胞极化在多种生物过程如胚胎发育、组织形成和免疫反应中发挥着重要作用。 例如 ,上皮细胞具有明显的顶端和基底端,顶端面向体腔或外界环境,而基底端则与基膜接触。神经元极化则表现为细胞体、轴突和树突的分化,每个部分具有特定的功能。这些极性差异使得细胞能够高效执行其生物功能。 这是第一种用于全面评估免疫细胞极化的计算方法。 免疫细胞 在受到各种刺激时会发生细胞因子驱动的极化,从而改变其转录谱和功能状态 ………………………………

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