Nat. Methods. | 基于单细胞和空间转录组学推断细胞间通信信号流动

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2024年8月26日，来自Qing Nie研究团队的Axel A. Almet、Yuan-Chen Tsai和Momoko Watanabe在 Nature Methods 期刊上发表了一篇题为“ Inferring pattern-driving intercellular flows from single-cell and spatial transcriptomics ”的研究文章。文章中，作者介绍了一种名为FlowSig的方法， 能够从单细胞RNA测序和空间转录组数据中推断出驱动模式的细胞间流动 。通过图形因果建模和条件独立性测试， FlowSig不仅能够揭示细胞间通信如何驱动信息流，还能捕捉到在疾病进展或外部刺激下的细胞间流动变化 。该研究的亮点在于其通过生成的数学模型和实验数据验证了FlowSig的准确性，并展示了其在多种研究中的应用， 例如解析胰岛素分泌、COVID-19严重程度与细胞间流动的关系，以及胚胎发育过程中的模式生成 。 关键字 空间转录组学 | 细胞形态学 | TESLA算法 引言 在生物体内，细胞通过一系列复杂 ………………………………