Nature method, tidyomics 生态系统：增强组学数据分析!

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研究背景 组学数据分析面临着数据处理、分析和整合的挑战。为了应对这些挑战，Bioconductor 作为开源平台提供了丰富的组学数据分析工具。另一方面，tidy R 编程范式以其直观的数据组织和处理标准，在数据科学领域掀起了一场革命。 ‍ 研究目的 ‍ 本研究介绍了 tidyomics 软件生态系统，它将 Bioconductor 与 tidy R 范式相结合，旨在简化组学分析流程，降低学习门槛，促进跨学科合作。 研究方法 ‍ tidyomics 生态系统：  tidyomics 包含三个新的 R 包：tidySummarizedExperiment、 tidySingleCellExperiment 和 tidySpatialExperiment，以及五个公开可用的 R 包：plyranges、nullranges、tidyseurat、tidybulk 和 tidytof。tidyomics 将组学数据以 tidy 格式呈现，但保留了原始数据容器和方法，确保与现有软件的兼容性以及 Bioconductor 的长期支持。 数据分析：  研究人员从 Human Cell Atlas 中收集了 75 ………………………………