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蛋白组学管道—— tidyproteomics

生信益站  · 公众号  ·  · 2024-11-21 08:00

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生信益站,一点就有益 ! 祝友友们天天开心,月月发 CNS~ 设我为🌟星标,每天就能第一时间看到推送啦~ 蛋白组学管道—— tidyproteomics 用于整理、后处理和分析定量蛋白质组学数据的 R 包。 蛋白质组学分析软件无法以精心设计的 tidy 格式输出数据 。 大多数此类工具生成的输出格式要么是混合了宽格式和长格式的数据结构,要么是带有混乱名称和添加符号的列标题,要么是经常令人困惑的变量名称。 这导致研究人员创建一次性脚本来清理和导入各种格式的数据,通常会创建一个无人维护的定制代码环境。 此包试图通过创建灵活的导入工具来统一多种格式并创建一个用于蛋白质组学分析的新 tidy 对象来解决该问题。 该软件包功能包括但不限于 数据导入 数据过滤 数据可视化 定量标准化和归因 双样本表达和术语富集分析 蛋白质推断、序列覆盖率 ………………………………

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