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中南大学王建新教授团队提出BANDRP模型,通过基于分子指纹和多组学的双线性注意力网络进行药物反应预测

智药邦  · 公众号  ·  · 2024-11-18 08:00
    

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预测药物反应(一般而言是预测药物在细胞系上的IC50的值)有助于药物发现与疾病的个性化治疗。目前,虽然已有一些人工智能方法用于药物反应预测,但这些方法仍然受到输入特征信息冗余和特征之间复杂相互作用的限制,因而难以有效整合与细胞系、药物及其已知反应相关的各种特征,以实现药物反应的精准预测。 2024年10月15日,中南大学王建新教授团队在Briefings in Bioinformatics上发表文章BANDRP: a bilinear attention network for anti-cancer drug response prediction based on fingerprint and multi-omics。 作者提出了基于肿瘤细胞系的多个组学数据和药物的多个分子指纹,提出了一种双线性注意力模型(Bilinear AttentioN model for Drug Response Prediction, BANDRP),用于预测潜在的药物反应。 与现有模型相比,BANDRP利用基因表达数据计算通路富集分数来丰富细胞系特征,并通过双线性 ………………………………

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