GRACE：人工计算酶学中的生成式再设计

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*欢迎大家去观看原文，并引用 标题：GRACE: Generative Redesign in Artificial Computational Enzymology 期刊：ACS Synth. Biol 网址：https://doi.org/10.1021/acssynbio.4c00624 图1所示。人碳酸酐酶（hCAII）基序识别与选择。(A) hCAII蛋白序列如图所示，选中的基序用橙色突出显示，催化三元体H94、H96和H119用蓝色标记。(B)显示hCAII的三维结构，其中选择的基序（青色）形成一个深空腔，催化三元体（H94， H96和H119）位于空腔的底部。 图2。自动化工作流程从头开始的酶设计。在翻译设计中，使用射频扩散生成新的骨干结构，然后通过ProteinMPNN进行解释。候选酶通过CLEAN筛选，预测EC数，并使用溶解度集合模型获得其溶解度。通过分子动力学（MD）模拟，进一步评估了trRosetta生成的预测结构与目标底物的稳定性和活性。最后，在转录设计中，通过TIsigner (https://tisigner.com)，利用密码子适应 ………………………………