利用GSVA包进行基因集变异分析（一）

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官网教程首页 包logo 官网教程地址：https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/GSVA/inst/doc/GSVA.html github地址：https://github.com/rcastelo/GSVA 摘要 GSVA 这种方法专注于 单个样本 的研究，其独特之处在于改变了传统分析中以基因作为基本单元的模式，转而以基因集为基础。这种转变使得能够从通路的角度更全面、深入地理解和分析表达谱数据，为研究基因功能和生物过程提供了新的视角和手段。 GSVA包提供了四种单样本基因集富集方法： zscore 、 plage 、 ssGSEA 以及其自身的 GSVA 方法。 尽管该方法最初是为基因表达数据开发的，但它 也可以应用于其他类型的表达谱数据。 本教程演示了如何使用GSVA包处理 芯片 和 Bulk 共两种常见的转录组数据。 Package GSVA 1.52.3 License: GPL (>= 2) 一、Quick start（快速体验） GSVA 是一个基于R语言的软件包，作为 Bioconductor 项目的 ………………………………