JIPB | 热科院品资所发表菠萝参考基因组：T2T 组装与“铂金级”基因结构注释

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菠萝，凤梨科凤梨属植物，果为聚花果，六月成熟，形同火焰，酸甜可口，香气浓郁，是世界性水果，也是热带地区重要园艺作物之一。目前已有数个菠萝基因组被解析报道，包括F153、MD2，CB5 和 Yugafu 等，为菠萝生物育种提供了重要基础。然而，这些材料仅覆盖了菠萝五大种 (一个食用种与四个其他变种) 中的两个，即食用种 (F153, MD2, Yugafu) 和观赏类品种 CB5 (即“红苞凤梨，作鲜切花用)。 近年，许多菠萝育种人员开始尝试种间杂交，试图将一些优异抗性和观赏性状引入菠萝食用种，进一步创制高抗水心病的食赏两用新品种。在实践过程中，菠萝参考基因组序列缺失、不连续，存在较多的Gap，尤其是着丝粒/端粒附近等序列，此外相应基因结构注释不完善，极大程度限制了菠萝分子辅助育种和基因编辑定向育种的工作进展。 日前，中国热带农业科学 ………………………………