​Genome Bio丨邵振/柳欣/詹丽杏团队开发多样本比较模型集zMAP解析红细胞分化和肝癌蛋白质组异质性

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TMT和 iTRAQ等重同位素标记技术已广泛用于蛋白质组定量分析，为研究组织发育和疾病进程中的蛋白质表达变化提供了基础。现有的蛋白质组差异分析工具主要面向两个或两组样本之间比较，能做多样本比较的工具还不多。尤其是这些平台生成的蛋白质组数据往往包含强烈的批次效应，导致能够整合多个质谱实验批次数据开展定量比较分析的工具更是匮乏，局限了它们在大规模生物样本分析中的应用。 中国科学院上海营养与健康所 邵振 课题组、 詹丽杏 课题组和分子细胞科学卓越创新中心 柳欣 课题组合作在 Genome Biology 发表了研究： zMAP toolset: model‑based analysis of large‑scale proteomic data via a variance stabilizing z‑transformation 。针对该瓶颈，研究者 开发了zMAP和reverse-zMAP两个新计算模型，并基于它们搭建了一个多功能的蛋白质组数据分析平台 (http://bioinfo.ce ………………………………