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CODEX:单细胞转录组的下一步?

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2024-09-18 22:00

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单细胞转录组做完了,我该如何收尾呢? 前段时间偶然了解到 全景多光谱组织扫描定量分析 ,但似乎这项技术更突出的是非常高清的超多色荧光。今天在重温 Mapping the cellular biogeography of human bone marrow niches using single-cell transcriptomics and proteomic imaging 的时候才发现他们用的是另一项技术配合单细胞转录组形成验证。 所以我们今天来对比一下这两项技术的优势,给大家提供参考~ 下面是全景多光谱组织扫描定量分析系统(TissueFAXS Spectra)和CODEX技术的对比表格: 特性 全景多光谱组织扫描定量分析系统 (TissueFAXS Spectra) CODEX技术 技术原理 多光谱成像技术,λ-stack成像和光谱拆分算法 带有DNA寡核苷酸共轭的抗体,循环图像采集 成像方法 连续光谱成像和拆分,多轮扫描识别不同标记物 循环加入荧光报告基团,多次循环实现多靶点成像 样本类型 ………………………………

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