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学习笔记总结于『生信技能树』马拉松课程 本文学习复现《Oxidative Stress Response Biomarkers of Ovarian Cancer Based on Single-Cell and Bulk RNA Sequencing》（基于单细胞和Bulk转录组的卵巢癌氧化应激反应生物标志物）一文中的图，其中Oxidative Stress Response缩写为ROS。文章包含了芯片、转录组、单细胞等技术，适合用来复现及学习 流程总结 六、生存模型的构建、预测、评分 本篇笔记的 1.TCGA数据整理 、 2.生存数据整理 全是模板代码，它们的详细笔记请见本公众号系列三、系列四； 3.生存模型构建 为新内容的笔记 1.TCGA数据整理 构建模型的时候不需要正常样本，从TCGA获取数据就行 图66 ### 1.包 rm(list = ls()) #library(TCGAbiolinks) library(stringr) #library(SummarizedExperiment) ### 2.下载并整理表达矩阵 # 去这个链接，找到你要的癌症的count和临床信息数据，下载下来放在工作目录下 #
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