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斯隆-凯特琳研究所Lareau等质疑Nature重磅文章:依赖于最少证据的mtDNA变异调用分析不可靠,ReDeeM验证不足

单细胞测序网  · 公众号  ·  · 2024-08-05 08:31
    

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导语 追踪谱系和克隆性的细胞条形码具有巨大的潜力,可以重新定义对发育和再生过程的理解,并研究疾病的发病机制。基于测序的体细胞线粒体DNA(mtDNA)和核DNA(nDNA)突变鉴定揭示了几乎所有人体组织(包括造血系统)中的克隆嵌合。 Weng等人 [1] 描述了具有深度线粒体突变分析(ReDeeM)的调节多组学,报告了前所未有的细胞间共享的mtDNA变体数量。然而,该结果是否可信? 单细胞测序网: 2024年7月29日,美国斯隆-凯特琳癌症研究所Caleb A. Lareau等人就美国哈佛医学院波士顿儿童医院Weng等人于2024年1月22日发表在 Nature 上的研究结论(Deciphering cell states and genealogies of human haematopoiesis)提出质疑,认为Weng等人提出的ReDeeM方法分析流程正交验证不足,在文库生成和序列比对上游存在大量技术伪影,可能误导系统发育推断。该文章“ Artifacts in single-cell m ………………………………

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