东京大学Ikuro Abe组Nat Catal | PLP依赖型烷基化酶催化NAD与SAM缩合反应的结构基础

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01 遇见/摘要 PLP 依赖型蛋白 SbzP 催化 β-NAD 的吡啶环与来源于 SAM 的富含电子  β,γ- 不饱和醌之间的  [3+2]  环化反应用于生物合成氮杂茚满抗生素。本文研究人员通过冷冻电镜解析 PseP (SbzP 同源蛋白 )  的 β-NAD 复合结构并且鉴定相关重要残基。此外分子模拟计算表明分步的反应机制比周环机制更为合理，本文研究加深对 PLP 依赖型酶的相关理解。 02 遇见/内容 研究人员在前期研究中发现 altemicidin  生物合成途径中 PLP 依赖型守门酶 SbzP 催化 β-NAD 和 SAM 之间的 [3+2]- 环化反应生成 6- 氮杂四氢茚满骨架（ 图 1a ）（ 详见往期推荐 1 ）。 SbzP 催化的反应是首例通过 PLP 介导的串联 Cγ 和 Cα 位烷基化反应。作者提议的 SbzP  的分步反应机理如 图 1b 所示。 PseP 的冷冻电镜结构分析   SbzP 与 α- 酮戊二酸依赖型加氧酶 SbzQ 可以形成融合蛋白，研究人员使用 SbzPQ ………………………………