肿瘤进化和微环境在二维和三维空间的相互作用——单细胞核RNA测序（snRNA-seq）+Visium空间转录组

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点击 蓝字 关注我们 2024年10月，美国华盛顿大学丁莉研究团队在《Nature》杂质上发表了“Tumour evolution and microenvironment interactions in 2D and 3D space” 的文章。该团队利用Visium 空间转录组学（spatial transcriptomics, ST）检测了来自6种不同癌症类型的78个病例的131个肿瘤切片，并将其与48个匹配的单核RNA测序样本和22个通过标签匹配的共检测 (co-detection by indexing, CODEX) 样本相结合。通过与2D和3D空间中的局部微环境相互作用来阐明空间肿瘤进化，为肿瘤生物学提供了宝贵的见解。 研究背景 耐药亚克隆经常出现在癌症中，肿瘤微环境（TME）可以通过多种机制进一步驱动耐药。肿瘤克隆演化仍然是癌症最棘手的问题之一，即肿瘤通过突变积累和基于适应度的选择对环境和治疗刺激的空间和时间适应。先前的研究主要集中在通过突变推断进化史，但新技术已经能够 ………………………………