PCR实验中，引物GC含量高，结合特异性就越强，真的是这样吗？

文章预览

图片来源：网络 在PCR(聚合酶链式反应《 干货 | PCR技术基本原理 》)中，引物的GC(鸟嘌呤-胞嘧啶)含量高确实在一定程度上与结合特异性增强有关联，但这种关系并非绝对，且存在复杂性和限制条件。 引物高GC含量，正向影响 (1) 氢键稳定性: G和C碱基之间可以形成三个氢键，而A和T碱基之间只能形成两个氢键。因此，当引物的GC含量较高时，其与模板DNA结合时形成的氢键数量更多，这使得结合更加稳定，增加了结合特异性。 图片来源：网络 (2) 退火温度: 由于GC碱基对之间的氢键更强，因此含有高GC含量的引物通常需要更高的退火温度才能与模板DNA有效结合。在适当的条件下，较高的退火温度有助于减少非特异性结合，从而提高PCR的特异性。 引物高GC含量，反 面影响和限制条件 (1) 二级结构形成: 高GC含量的引物可能更容易形成二级结构(如发夹结构)， ………………………………