主要观点总结
本文研究了小鼠胚胎骨骼组织中软骨细胞的转录组和染色质特征,鉴定出软骨细胞特异性增强子并分析了它们在骨骼发育和身高差异中的作用。研究者还通过体内实验验证了特定软骨细胞增强子在调控基因表达中的作用。
关键观点总结
关键观点1: 研究背景
软骨细胞分化在骨骼发育和身高控制中起关键作用,但调控这一过程的转录调控机制尚不明了。尽管已经发现一些参与软骨细胞分化的关键基因,但其表达调控机制,尤其是远端调控增强子的作用,尚未被全面阐明。
关键观点2: 研究成果
通过联合分析小鼠胚胎骨骼组织中软骨细胞的ATAC-seq、ChIP-seq和RNA-seq多组学数据,研究者识别出了780个软骨细胞特异性基因和2704个软骨细胞特异性增强子。这些增强子大多数表现出泛软骨源活性,小部分局限于肢体或躯干软骨细胞。与这些软骨细胞特异性增强子重叠的遗传变异能更好地解释身高差异。
关键观点3: 研究验证
研究者通过靶向敲除Fgfr3、Col2a1、Hhip和Nkx3-2基因座上的特定增强子,验证了它们在调控相应基因表达中的重要作用。这些增强子在维持发育过程中的模式基因表达中发挥了重要作用。
关键观点4: 研究意义
这些发现提供了一个综合的软骨细胞特异性增强子图谱,为了解基因和非编码变异如何影响骨骼发育和人类身高奠定了基础。此外,这些发现也为利用非编码变异解释罕见骨骼疾病的遗传学基础提供了新的思路。
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chondrogenic enhancer landscape of limb and axial skeleton development 作者: Fabrice Darbellay, Anna Ramisch, Lucille
Lopez-Delisle, Michael Kosicki, Antonella Rauseo, Zahra Jouini, Axel Visel,
Guillaume Andrey. (Department of Genetic Medicine and Development, Faculty of Medicine,
University of Geneva, 1211Geneva, Switzerland.) 发表期刊 : Nat Commun . 2024 Jun 6. Doi:10.1038/s41467-024-49203-2. 科学问题 软骨细胞分化和增殖是骨骼发育的关键过程,但调控这一过程的转录调控机制尚不明了。尽管已经发现一些参与软骨细胞分化的关键基因,但其表达调控机制,尤其是远端调控增强子的作用,尚未被全面阐明。因此,研究者希望通过对软骨细胞特异性增强子的全面鉴定,来更好地理解软骨细胞分化和骨骼发育的转录调控机制,并探讨这些增强子在人类骨骼发育和疾病中的作用。 重要发现 1. 通过联
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