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Genome Biol | 突破传统直接RNA测序局限!新方法可同时检测多类ncRNA和mRNA

测序中国  · 公众号  ·  · 2024-09-19 14:30
    

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RNA测序技术自问世以来经历了多次迭代,但这些技术在RNA修饰鉴定、RNA结构和剪接变化分析方面仍存在挑战。近年来,PacBio和Oxford Nanopore Technologies(ONT)等公司的测序平台不断发展,尤其是Nanopore平台可直接对自然RNA链进行测序,并简化文库制备和分析过程。 目前,科研人员已表征超100种独特的RNA修饰,包括腺苷到肌苷(A-to-I)编辑、假尿嘧啶修饰等;其中,非编码RNA(ncRNAs)是这些修饰的常见靶点,对人类健康和疾病具有重要意义。Nanopore平台的直接RNA-seq方法在RNA修饰检测分析方面具有潜力,但其在文库制备过程中使用poly(A)选择的标准直接RNA-seq方法,这限制了对许多不同类型ncRNA的捕获。 近日,加拿大曼尼托巴大学的科研团队在 Genome Biology 发表了题为”NERD-seq: a novel approach of Nanopore direct RNA sequencing that expands representation of non-coding RNAs”的文章 ………………………………

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