Nature Communications｜重新评估并提升环境细菌的可培养率

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近日，厦门大学生命科学学院郭峰副教授课题组在《Nature Communications》期刊上发表了题为“Sequencing-guided re-estimation and promotion of cultivability for environmental bacteria”的研究论文。研究聚焦于环境细菌的低可培养率这一广泛认知的问题。以往对细菌可培养率的估计多是基于可培养细胞的比例，但从微生物资源和多样性角度来看，关注可培养类群占所有类群的比例更加重要。由于培养条件与微生物在自然环境中的生长条件差异较大，目前大多数微生物仍被归类为“不可培养”或“未培养”状态，其中包括一些在高分类阶元（如门、纲等水平）没有代表菌株的“微生物暗物质”。该研究通过结合细胞计数、16S rRNA基因扩增子测序、宏基因组学以及在琼脂平板上的多种培养条件，重新估算了来自土壤和活性污泥这两类样品的环境细菌可培养率，并将结果与传统 ………………………………