NAR|AI革新基因组学: AutoHiC助力染色体级别基因组组装

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目前染色质构象捕获（ Hi-C ）技术为染色体水平的组装提供了便利，但挂载过程仍然面临着很大的挑战。这是因为当用 Hi-C 技术挂载染色体时，挂载工具往往存在一定的缺陷，挂载结果需要手动修正。 因此，实现自动纠正挂载错误和染色体划分，对于基因组组装具有重要意义。 近日，西南大学前沿交叉学科研究院生物学研究中心 王翊 教授研究组在基因组组装研究中取得了进一步进展。相关研究成果于2024年9月17日以 A deep learning-based method enables the automatic and accurate assembly of chromosome-level genomes 为题发表在 Nucleic Acids Research 上。该研究提出了 AutoHiC ，一种基于深度学习的方法，旨在自动检测和纠正基因组挂载中的错误，极大提高了基因组组装的连续性和准确性。 AutoHiC 利用 Hi-C 数据，通过全自动化的工作流程和迭代错误纠正机制，显著提升了基因 ………………………………