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来源:小柯生命 北京时间2024年6月25日17时,美国德州农工大学张秀任团队在Nature Plants杂志在线发表题为“Parallel degradome-seq and DMS-MaPseq substantially revise the miRNA biogenesis atlas in Arabidopsis”的研究论文。 该研究创新性利用具有部分DCL1内切酶活性的显性负突变体(dominant-negative mutant),结合降解组测序(Degradome-seq)及硫酸二甲酯突变分析与测序(DMS-MaPseq)技术,重新注释了植物拟南芥体内 的miRNAs, 系统地揭示了其前体pri-miRNAs精准剪切图谱及全基因组pri-miRNAs二级结构,进一步阐明了不同miRNAs剪切模式背后的序列结构决定因素。 上述研究成果不仅有助于厘清生理条件下 植物pri-miRNAs 精准剪切加工的原则及机制,为设计更高效的artificial-miRNA 及作物育种提供新的理论依据,也为开展其他作物及物种基因组重测序及miRNA注释相关工作提供了重要借鉴。 非编
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