专栏名称: 单细胞天地
对应生信技能树论坛›研究热点›单细胞测序版块,力求全方位收集整理分享单细胞测序数据的应用,涵盖多种组学,多种疾病,发育机理,药物开发等等
今天看啥  ›  专栏  ›  单细胞天地

走inferCNV流程的时候只需要针对上皮细胞即可

单细胞天地  · 公众号  ·  · 2024-09-15 22:57
    

文章预览

前面在: 为什么胃癌并不使用拷贝数来判断恶性的肿瘤上皮细胞呢 ,我提到了对于胃癌,它跟其它上皮细胞来源的癌症有一点点不一样的地方是,它的上皮细胞相对来说没有那么的恶性, 以至于走inferCNV流程的时候它甚至没办法在拷贝数变异程度这个指标去跟免疫细胞或者基质细胞进行区分! 实际上,有一个很简单的改进方法, 就是不要试图去对整个表达量矩阵进行走inferCNV流程。因为大多数癌症里面的恶性的肿瘤细胞确实起源于上皮细胞,这类癌症被称为上皮源性癌症或 carcinomas。上皮细胞是覆盖在身体表面(包括皮肤)和体内腔道(如消化道、呼吸道、泌尿生殖道)的细胞,它们也构成了器官的内衬。由于上皮组织在身体中的广泛分布,上皮源性癌症是最常见的癌症类型。上皮源性癌症的例子包括但不限于: 肺癌 乳腺癌(虽然乳腺癌发生在 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览