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单细胞分析整理分组信息重要咩?

生信漫漫学  · 公众号  ·  · 2024-12-25 11:56
    

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写在开头 hhh坚持更新了一段时间,昨天突然没有推文好发还有点点不适应呢,看来就是没带手机上班的这段时间学习工作状态还可以呀! 本来是要继续整理cellchat相关的内容的,但是早上和来学习的大伙伴聊到了单细胞分析中整理分组信息的重要性和便利性,所以这期就一起先聊一下单细胞分析中整理分组信息的内容叭! 单细胞数据分组信息来源 单细胞数据分组信息来源基本上就是数据集的样品简介、样品详情以及文献的介绍及附件表格! 在小谢的 #单细胞 合集里面,会有日常直播分享数据集的分析代码,基本上很多数据都是整理了分组信息的 比如 上次的 GSE174401—黑色素瘤中枢神经系统转移 就有基于提供的mapping信息整理了对应的分组信息 那单细胞分组信息从哪里找到呢?一般GEO数据可以直接看对应的sample样品信息,基本会把对应的分组信息 ………………………………

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