Nature Commun | 胡健/王凌华团队合作通过整合细胞形态学和空间转录组学深度剖析肿瘤生态系统

文章预览

编者按 精确识 别肿瘤微环境中的不同区域和细胞类型对于肿瘤的临床诊断和治疗策略选择至关重要。 空间转录组技术的发展提供了研究肿瘤微环境中细胞互作的宝贵信息。这项技术生成的数据不仅反映了组织的空间基因表达，还包含了病理切片信息（H 图像）。 因此，将病理切片中的细胞形态学特征与空间基因表达数据结合起来，对细胞类型和状态的精确分类成为了空间转录组分析中的一个迫切需求。 2024年8月25日，埃默里大学（Emory University）的胡健团队与得克萨斯大学MD Anderson肿瘤医院的王凌华团队在《 Nature Communications 》上发表论文 METI: Deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics ，介绍了一种新的空间转录组数据分析框架。胡健和王凌华担任共同通讯作者，博士生蒋嘉汇是该论文的第一作者。 不同于很多现有的工 ………………………………