专栏名称: 生信分析手册
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4+共病+WGCNA+PPI+实验验证,只要疾病选的好,简单分析也能发高分,抓紧上车卷一篇!!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-08-16 18:08

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Exploration of shared gene signatures and molecular mechanisms between type 2 diabetes and osteoporosis”,这篇文章发表在 J Cell Mol Med 期刊上,影响因子为4.3。 GEO信息 根据既定标准,选择了四个GEO数据集:GSE15932,GSE148961,GSE62402和GSE201543.有关数据集的信息(包括GSE编号、检测系统、样品和RNA来源类型)见表1.GSE15932匹配GSE62402生成 mRNA 发现队列,而GSE148961与GSE201543用于miRNA分析。 T2D中mRNA的鉴定与分析 通过分析 8 个正常样品和 8 个 T2D 样品之间的差异表达谱,鉴定出 60 个 mRNA 与 T2D 相关,如热图和火山图所示(图1A).富集分析表明,这些mRNA参与各种生物过程。值得注意的是,确定了三个与T2D相关的BP术语,即“中性粒细胞胞外陷阱形成”、“利什曼病”和“破骨细胞分化”(图1C).上调差异表达mRNA的BP术语包括“阿米巴病”、“谷胱 ………………………………

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