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Nature| GWAS 数据的空间革命:gsMap 如何绘制复杂性状的「基因-空间图谱」

生信益站  · 公众号  ·  · 2025-03-21 09:10
    

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最近,来自 Nature 一篇文章介绍了一种名为 gsMap 的新方法,用于将人类复杂性状(包括疾病)与细胞在空间上的分布进行关联映射。 gsMap 结合了空间转录组学(ST)数据和全基因组关联研究(GWAS)的汇总统计数据,能够在单细胞分辨率下绘制与复杂性状相关的细胞空间分布图。通过使用胚胎期的空间转录组学数据集,作者验证了 gsMap 的有效性,并展示了其在揭示与精神分裂症、认知和情绪相关的大脑细胞分布中的应用。 研究结果表明,gsMap 能够提供关于复杂性状相关细胞的空间分布及其相关基因的生物学见解。该方法不仅揭示了与精神分裂症相关的谷氨酸能神经元在背侧海马的分布,还发现了与抑郁症相关的神经元在前额叶皮层的分布。这些发现为理解复杂性状的生物学机制提供了新的视角,并具有潜在的临床应用价值。 源代码:https://github.com ………………………………

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