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Nat Methods | 汤富酬组开发出scNanoSeq-CUT 技术,可精准检测单细胞基因组复杂区域的染色质修饰

测序中国  · 公众号  ·  · 2024-10-11 15:58

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蛋白质是生命活动的核心分子,能够精确调控细胞内复杂的生命过程。很多重要的蛋白质(例如:共价修饰后的组蛋白和转录因子等)通过与基因组DNA相互作用,调控了细胞的表观遗传状态,进而影响基因的转录活性和表达模式。大量研究表明,表观遗传修饰状态的变化与胚胎发育、癌症以及其他多种疾病的发生密切相关。因此,精准解析蛋白质-DNA的相互作用对于深入理解表观遗传修饰对于发育、癌症以及其他疾病的基因转录调控机制至关重要。 近年来随着测序技术的发展,染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-seq)已经成为研究蛋白质-DNA相互作用的“金标准”。 然而,传统的ChIP-seq技术具有很多局限性,包括需要大量的起始细胞、重复性较差、信噪比低、成本高等问题。 2015年,首个单细胞ChIP-seq技术scDrop-ChIP问世,但scDrop-ChIP在单个细胞中捕获的组 ………………………………

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