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导语 今天给同学们分享一篇生信文章 T proliferating cells derived autophagy signature associated with prognosis and immunotherapy resistance in a pan-cancer analysis”,这篇文章发表在 iScience 期刊上,影响因子为5.8。 结果: 自噬途径中的失调在泛癌分析中的研究 研究设计的流程图如图1所示。最初,为了对自噬途径进行分类,我们通过整合已发表的数据库,包括Human Autophagy Database(232个基因)和Molecular Signatures Database(v4.0),以及先前发表的论文,手动整理了一个自噬相关基因列表。总共获得了256个自噬相关基因(表S3)。我们定义了一个全癌自噬转录标志,以研究自噬途径在不同癌症类型中的失调情况,因为自噬途径在组织类型间的转录组变异性(图2A;图S1A)。 泛癌自噬特征与预后相关 进一步将上自噬和下自噬得分分为四分位数(Q1-Q4),以研究它们的预后情况,参
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