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园艺研究必备!北京农学院郑轶团队开发园艺作物基因组搜索引擎

iPlants  · 公众号  ·  · 2024-07-13 20:01

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来源:北京农学院 园艺作物包括水果、蔬菜、观赏、饮料、药用和芳香植物,其在粮食安全和人类健康以及园林绿化方面发挥着重要作用。近年来,随着测序技术的不断发展,数百种园艺作物的基因组被破译,为解析基因功能和改良园艺作物提供了数据基础。然而,这些基因组数据分散在不同的数据库中,且具有各种复杂的搜索和显示策略,增加了学习和使用成本,并使不同园艺作物的比较和功能基因组分析非常具有挑战性。 2024年6月,Horticulture Research 在线发表了北京农学院农业应用新技术北京市重点实验室郑轶团队完成的题为“HortGenome Search Engine, a universal genomic search engine for horticultural crops” 的研究论文。 该研究开发了一个园艺作物基因组搜索引擎HSE (HortGenome Search Engine,  http://hort.moilab.net),可以查询园艺作物基因组的基因、功能注释和同源 ………………………………

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